No ano de 1958, foi criada a Capela Nossa Senhora de Fátima, iniciativa do pároco da Paróquia São Paulo Apóstolo, Frei Bráz Reuter, em terreno onde atualmente se localiza o Posto de Saúde Afonso Habe. No dia 13 de maio de 2018, Dom Rafael Biernaski presidiu missa de comemoração do jubileu de diamante da comunidade. Foram também entronizadas na Matriz as relíquias dos Santos Francisco e Jacinta Marto, canonizados em Fátima no dia 13 de maio de 2017 pelo Papa Francisco.

Atendida pastoralmente pelos franciscanos enquanto estiveram na Matriz, depois Catedral e, com a saída deles, pelo clero secular. Em 1975, nova área é adquirida na Rua João Sabino de Souza, para ampliação das instalações. No ano de 1984 foi nomeado Francisco José Klöppel para presidente da comissão de construção e mais vinte e cinco conselheiros. No ano seguinte, deu-se o lançamento da pedra fundamental e após seis anos, em 17 de março de 1991, as obras foram concluídas. A antiga capela foi demolida no final de 1988. O projeto é de autoria da arquiteta Claudia Siebert.

Em 04 de setembro de 2007, o Conselho de Presbíteros da Diocese de Blumenau decidiu a criação da Paróquia Nossa Senhora de Fátima e no dia 09 de setembro aconteceu sua instalação. No dia 10 de setembro, estaremos comemorando 10 anos de criação da Paróquia.
A imagem da padroeira é portuguesa de Fátima, em madeira pintada à mão, e chegou a Blumenau no dia 13 de outubro de 1996, primeiramente para a Paróquia Nossa Senhora Aparecida e, em maio de 2008, ofertada pela mesma a esta Paróquia. No ano de 2017, a comunidade recebeu do Santuário de Fátima, coroa e rosário do centenário das Aparições.

Nos dias 12 e 13 de outubro de 2018, a Paróquia recebe a visita da família de Lucas Maeda de Oliveira (de Juranda, Paraná), agraciado com o milagre reconhecido pela Igreja e que culminou com a canonização dos Beatos Francisco e Jacinta Marto. Em novembro de 2018 a Matriz recebe as imagens dos Santos Pastorinhos canonizados em Fátima no dia 13 de maio de 2017, pelo Papa Francisco.

PADRES ANTECESSORES
1) Pe. Walmir Marcolino Gomes, primeiro pároco (de 09/09/2007 a 27/01/2013).
2) Pe. Jairson José Kienen, administrador paroquial (de 03/02/2013 a 14/08/2016.
3) Pe. Antônio Francisco Bohn, segundo pároco (desde 17/08/2016).